ก่อนการผ่าตัดแปลงเพศนั้น  แน่นอนว่าจะต้องมีการเตรียมตัวก่อนที่จะเข้าทำการผ่าตัดแปลงเพศ  การตั้งเนื้อตัวตัวก่อนผ่าตัดแปลงเพศ มีเช่นนี้

1.งดน้ำและเครื่องกินตามแพทย์สั่ง 8 ชั่วโมง ก่อนการผ่าตัดแปลงเพศ

2.ควรพักสมองให้พอเพียงก่อนการผ่าตัดแปลงเพศ

3.หยุดใช้ยาฮอร์โมน 4 สัปดาห์ ก่อนการผ่าตัด ทุกชนิด

4.ในกรณีที่มีโรคประจำตัวที่ต้องทานยาปกติ ให้แจ้งหมอในวันที่นัดขอความเห็น เนื่องแต่ยาบางชนิดอาจต้องแจ้งให้วิสัญญีนายแพทย์ทราบก่อนการผ่าตัด

5.ยาที่เสนอแนะให้หยุดทานก่อนการผ่าตัด 2 อาทิตย์ ได้แก่ ยากลุ่ม แอสไพรินหรือบลูเฟน วิตามินอี สมุนไพรบางอย่าง เช่น หอมเทียม ใบแปะก๊วย เหตุเพราะยาพร้อมทั้งสมุนไพรดังกล่าวข้างต้นมีผลทำให้สายเลือดออกง่าย

6.ควรงดดูดบุหรี่ กับดื่มแอลกอฮอล์ ก่อนผ่าตัด 4-6 อาทิตย์

7.ควรลาหยุดงาน 3-4 อาทิตย์ เพื่อด้วยการผ่าตัด กับการพักฟื้นหลังผ่าตัด

8.ควรมีญาติมาด้วยในวันผ่าตัด เพราะ 1-2 วันแรกจะไม่สามารถบรรเทาทุกข์ตัวเองได้ดี พร้อมกับไม่ควรขับรถมาเองในวันผ่าตัด

9.ควรชำระล้างชำระล้างร่างกายก่อนผ่าตัด เนื่องมาจากหลังผ่าตัดจะไม่สามารถอาบน้ำอาบท่าได้คะเน 6 วัน

10.ไม่ควรนำวัตถุปัจจัยมีค่าประจำตัวมาในวันผ่าตัด

11.นำคู่มือที่ชอบอ่าน หรือ DVD ที่ชอบดู เตรียมไปที่โรงพยาบาล เพื่อใช้ในช่วงหลังผ่าตัดวันที่ 3 และ 4

12.เตรียมเครื่องแต่งตัวที่ใส่หลังผ่าตัด ควรเตรียมกระโปรงหลวมๆ ไม่ควรใส่กางเกงเพราะจะทำให้เจ็บแผลเป็น

13.ในกรณีที่ผล HIV เป็นบวก อาจต้องตรวจ CD4 ถ้าอยู่ในเกณฑ์ปกติ จะสามารถทำการผ่าตัดได้ แต่ถ้ามีค่า CD4 ลดลงปรกติ ควรทำการรักษาโรค HIV ก่อน จนค่า CD4 ปกติดี  ผู้ที่มีผลสายเลือดเป็นบวก จะมีค่าใช้จ่ายเพิ่มปริมาณประมาณ 100 %

14.ในวันก่อนผ่าตัดถ้าเป็นไข้หวัด หรือไม่สบายควรเลื่อนการผ่าตัดไปก่อน

15.ถ้ามีโรคติดเชื้อทางเพศสัมพันธ์อื่น เช่น หูดหงอนไก่ เริม แผลริมอ่อน ควรคุ้มกันให้หายก่อนนัดผ่าตัด ด้วยเหตุว่าหลังผ่าตัดการคุ้มกันการติดเชื้อทำได้ชั่ว